1
Alliance of Genome Resources
Alliance of Genome Resources，由7个模式生物数据库(model organism databases，MODs)和GO数据库组成，其目标是向所有生物学、临床医学相关的研究人员提供一个综合的信息平台，促进使用多种模式生物来理解与人类健康和疾病的相关机制。
数据库链接：
https://www.alliancegenome.org/
2
Human Protein Atlas
人类蛋白质图谱（Human Protein Atlas）是一个始于2003年的瑞典项目，旨在利用多种组学技术（包括基于抗体的成像技术、基于质谱的蛋白质组学、转录组学和系统生物学）绘制细胞、组织和器官中所有人类蛋白质的图谱，该数据库中的所有数据都是开放获取的。
数据库链接：
https://www.proteinatlas.org/
3
GeneCards
GeneCards是一个可搜索的综合数据库，提所有已注释的人类基因信息。该知识库以基因为中心自动整合来自大约150个数据库的数据，包括基因组学、转录组学、蛋白质组学、遗传学、临床学等信息。
数据库链接：
https://www.genecards.org/
4
KEGG pathways
KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）是从基因和分子网络的角度系统分析基因功能的在线数据库，在1995年５月，在人类基因组计划框架下由日本京都大学化学研究所Minoru Kanehisa发起的。其中，KEGG PATHWAY是KEGG数据库最主要的部分，包含大多已知的代谢通路图（metabolic pathways）和调控通路图（regulatory pathways）。
数据库链接：
https://www.genome.jp/kegg/
实操教程：《想了解KEGG数据库？一起来“考古”》
5
Wiki pathways
KEGG PATHWAY数据库是我们最熟悉的通路数据库，这里再分享一个功能类似的数据库，可以查找和下载目标物种的通路图。
数据库的链接：
https://www.wikipathways.org/index.php/WikiPathways
在Wiki pathways主页的Find Pathways区域，我们可以通过输入关键词（如通路名称、基因或蛋白名称、疾病名称等）查找感兴趣的通路图，比如这里输入Apoptosis（细胞凋亡）后点击Search按钮，查找得到的pathways的如下：
实操教程：《如何查找感兴趣的通路图？》
6
NCBI Gene
当我们在进行基因功能研究的时候，首先要查看这个基因的基本信息。上文介绍过使用GeneCards数据库可查找与人相关的基因信息。但如果想查找更多物种的基因功能信息，我这里推荐大家使用Gene数据库。
Gene数据库的使用方法很简单，我们只需在搜索框中输入基因相关的关键词，比如基因名(symbol)，我这里输入BRCA1基因，然后点击Search按钮，得到的结果如下。
数据库链接：
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/
实操教程：《如何查找感兴趣基因的信息？》
7
HGNC
HGNC(HUGO Gene Nomenclature Committee) 负责提供人类基因唯一的名称，包括蛋白质编码基因、ncRNA基因和假基因，以便科研人员进行明确的科学交流。
数据库链接：
https://www.genenames.org/
8
PDB
Protein Data Bank(PDB) 为存储蛋白质结构的数据库，提供蛋白的结构解析和功能注释。我们可以通过PDB查找蛋白的3D结构信息。
数据库链接：
https://www.rcsb.org/
9
UniProt
UniProt（Universal Protein Resource）是一个综合性的蛋白质数据库，提供了全球范围内已知的蛋白质序列和功能信息。其中，UniProtKB（UniProt Knowledgebase）是最核心的组成部分，包含了经过注释和分类的蛋白质序列和功能信息。它提供了详细的蛋白质注释，包括序列特征、结构域、功能、亚细胞定位、酶活性等。
数据库链接：
https://www.uniprot.org/
实操教程：
《听说画好看的进化树需要知道这2个数据库》
10
InterPro
InterPro是一个蛋白质家族的数据库，提供完整、准确的蛋白质家族和结构域的分类信息。主要通过对蛋白质进行分类以及预测结构域和重要位点，来提供蛋白质的功能分析，这对蛋白的功能研究非常有帮助。
数据库链接：
https://www.ebi.ac.uk/interpro/
11
BioGRID
BioGRID是一个基因相互作用的数据库，数据主要来源于文献挖掘，包括常规实验结果和高通量数据验证结果，使用它可以轻松完成基因互作关系的预测。
数据库链接：
https://thebiogrid.org/
实操教程：《分享一个基因蛋白互作数据库》
12
dbSNP
dbSNP（Single Nucleotide Polymorphism Database）存储了人类和其他物种的单核苷酸多态性数据，对研究遗传变异很有帮助。
数据库链接：
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/
好啦，本次的实用数据库分享就先到这里啦！
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评论列表（4条）
我是调研号的签约作者“苏飞鸿”！
希望本篇文章《数据库系统有哪些/常用的数据库系统有哪些》能对你有所帮助！
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